Program Studi (Prodi) Doktor Biologi merupakan Prodi Doktor ke-4 yang dikelola Fakultas MIPA Universitas Hasanuddin. Adapun Program Studi Doktor yang telah berdiri adalah Doktor Ilmu Kimia, Matematika, dan Fisika dan ke-3 prodi tersebut telah menghasilkan lulusan.
Departemen Biologi Fakultas MIPA Universitas Hasanuddin pada awalnya hanya memiliki satu prodi, yakni: Program Studi Sarjana Biologi (PSB S1) berdiri sejak tahun 1963, sudah lebih setengah abad melaksanakan tri dharma perguruan tinggi yaitu pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat di bidang biologi. Pada awal pendiriannya, Departemen Biologi merupakan bagian Fakultas Ilmu Pasti dan Pengetahuan Alam (FIPPA), selanjutnya tahun 1977 menjadi bagian Fakultas Sains dan Teknologi sesuai KEPRES No. 68/1982. Seiring perjalanan waktu program studi biologi (PSB S1) mengalami pengembangan sarana dan prasarana serta peningkatan kualitas sumber daya manusia, khususnya tenaga pendidik. Jumlah tenaga pendidik sampai saat ini ada 30 orang, dengan prosentase yang berkualifikasi pendidikan S3 yaitu 66.7% (20 orang dan 11 di antara memiliki jabatan fungsional profesor).
Selanjutnya pada tahun 2017, Departemen Biologi melakukan pengembangan program studi ke jenjang yang lebih tinggi, yakni: Pembukaan Program Magister Biologi yang mendapatkan ijin pembukaan dan juga mendapatkan akreditasi minimum dari BAN PT tahun 2017 dengan nomor 2331/SK/BAN-PT/Akred-Min/M/VII/2017, tertanggal 18 Juli 2017. Selanjutnya dilakukan reakreditasi pada tahun 2018 dan mendapatkan kategori B dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi berdasarkan Keputusan BAN-PT No. 2563/SK/BAN-PT/Akred/M/VII/2019 pada tahun 2019 yang berlaku sejak tanggal 23 Juli 2019 sampai dengan 23 Juli 2024. Selanjutnya dilakukan reakreditasi untuk yang pertama kalinya mendapatkan status akreditasi UNGGUL dari LAMSAMA berdasarkan Surat Keputusan LAMSAMA No. 081/ SK/ LAMSAMA/ Akred/ M/ VIII/ 2024. Ketersediaan sarana, prasarana, dan potensi tenaga pendidik pada Departemen Biologi yang berjumlah 30 orang, dimana jumlah dosen yang berpendidikan S3 adalah 70%, S2 30% mengembangkan pendidikan lanjutan, jenjang Program Studi Doktor Biologi.